《马氏文通》对之后的汉语语法著作产生了很大影响，例如章士钊的《中等国文典》、陈承泽的《国文法草创》、杨树达的《高等国文法》，黎锦熙的《新著国语文法》都是因袭《马氏文通》的体系。甚至后来的吕叔湘的《中国文法要略》、王力的《中国现代语法》也受到它的影响。《马氏文通》也存在着许多缺点。例如过于模仿拉丁语系统等。
《马氏文通》全书分10卷。卷一讲正名，介绍主要的术语，相当于该书的语法大纲。卷二至卷九依次论述各类实词和虚词。卷十论句读，是句法的总论。书中将汉语的词类分为九种，分别是名词，代词，动词，形容词，副词，介词，连词，助词，叹词。又将句子成分定为七种，分别是主语，谓语，宾语，表词，外动词，加词。汉语语法的问题在书中基本上都谈到了。内容收录了上自晚清下至20世纪80年代末中国大陆及港澳台地区、海外华人学者的原创学术名著（包括外文著作），以人文社会科学为主体兼及其他，涵盖文学、历史、哲学、政治、经济、法律和社会学等众多学科。