《圣济总录》疾病分为66门，每门之下再分若干病证，就较《太平圣惠方》分1000余门清晰明了，许多疾病的归类也比较合理。其所录方剂中，丸、散、膏、丹、酒剂等明显增加，充分反映了宋代重视成药的特点。北宋末年政府主持医家编纂，以宋徽宗名义颁行。政和年间(1111～1118)，徽宗赵佶诏令征集当时民间及医家所献大量医方，又将内府所藏的秘方合在一起，由圣济殿御医整理汇编而成。全书包括内、外、妇、儿、五官、针灸、养生、杂治等，共66门，而把运气内容列于全书之首，这与宋徽宗崇信五运六气学说有关。“运气”之下还有“叙例”、“治法”等篇，相当于全书的总论部分，自“诸风”起至“神仙服饵”各门，相当于全书的各论部分。每门之中部有论说，词简义赅，总括本门，其下又分若干病证。凡病因病机、方药、炮制、服法、禁忌等均有说明。全书共收载药方约2万首，既有理论，又有经验，内容极为丰富。在理论方面，除引据《内经》、《伤寒论》等经典医籍，亦注意结合当时的各家论说，并加以进一步阐述，在方药方面，以选自民间经验良方及医家秘方为主，疗效比较可靠。本书较全面地反映了北宋时期医学发展的水平、学术思想倾向和成就。