全书共25篇，主要有“药误永鉴”：以病案形式，结合一个专题进行辨析，以警示后学及同行不要犯误治之错，“名方类集”：精选古今效方766首，以证系方，理法具备，论述临证各科疾病的诊治。为该书主要部分，“药类法象”：简述张元素、李杲的药物学理论，如性味、功效等；“医验记述”：载录作者长期从事临床的诊治经验，内容丰富；最后为“补遗”，选辑张仲景以下诸家有关外感、中暑等病证的验方，为元代以后他人所补充之内容。
该书理论上本于《素问》、《难经》以求其因，并充分吸收李杲的“脾胃学说”及张元素、张璧、钱乙等医家的认识，围绕临证脏腑杂病的辨证论治理论进行系统阐发，具有鲜明的“易水学派”特色。在临证用药时，以很大篇幅介绍洁古、东垣的有关药物理论，并强调药证相对、名实相符、随证加减等灵活的辨证用药思想。