扶苏秦始皇长子，因其母郑妃是郑国人，喜欢吟唱当地流行的情歌《山有扶苏》，始皇便将两人之子取名“扶苏”，“扶苏”是古人对树木枝叶茂盛的形容，秦始皇以此命名，显见对此子寄托着无限的期望。
年少时的扶苏机智聪颖，生具一副悲天悯人的慈悲心肠，因此在政见上，经常与暴虐的秦始皇背道而驰。始皇偏执的认为这是扶苏性格软弱所致，于是下旨让扶苏协助大将军蒙恬修筑万里长城，抵御北方的匈奴，希望籍此培养出一个刚毅果敢的扶苏。
几年的塞外征战果然使扶苏成长得与众不同，他身先士卒、勇猛善战立下了赫赫战功，敏锐的洞察力与出色的指挥才能让众多的边防将领自叹弗如。他爱民如子、谦逊待人更深得广大百姓的爱戴与推崇。
就在扶苏热切期待回到朝堂一展宏图之时，始皇一旨诏书传至上郡，竟是责备他办事不利，赐其与将军蒙恬自尽。扶苏悲愤交加，便欲自刎，老将军蒙恬却发现诏书措辞隐有破绽，制止扶苏，意欲亲身晋见始皇。可钦差令旗高举，挥兵相加，蒙恬与亲信将领拼死救出扶苏，逃离上郡。
天地虽大，似再无扶苏存身之地，为了洗刷罪名、查明真相，扶苏毅然走入了山雨欲来风满楼的秦末乱世。